В сентябре климат в Плодопитомническом можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 15 градусов тепла. В среднем в сентябре в Плодопитомническом 11 дней с переменной облачностью, 8 дождливых, 7 ясных и 4 пасмурных дня. Дожди преимущественно слабые.