В сентябре климат в Транспортном можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 4 градуса тепла. В среднем в сентябре в Транспортном 11 пасмурных, 9 дождливых, 5 ясных, 4 со снегом и 1 день с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, марте и мае Транспортный cчитается местом, некомфортным для посещения.