Да, очень часто происходит закисание грунта. А так весь грунт должен быть одинаковым по размеру - чтобы равномерно в него проникали кислород, водоросли и бактерии. Ведь у каждой подложки есть свои особенности - изучите их внимательно.
Хотя многие аквариумисты со стажем считают, что естественный ил лучше, чем подложка. То есть заиливание грунта. При этом сифонируют раз в год. А подложка через года два закисает, невсякая, конечно. Тут надо выбирать.
Минус только один, необходим опыт содержания аквариума и понимания всех процессов происходящих в аквариуме. Так как аквариум замкнутая система его благополучие полностью зависит от владельца аквариума.