Чтобы показалась всплывающая подсказка, нужно чтобы было указано что-то в поле name. Вы можете указать статичный текст в шаблоне всплывающей подсказке, тогда она будет отображаться.
YMaps.Templates.add("default#hintContent", new YMaps.Template('
Hint Template
'));
В случае с KML вы можете поступить следующим образом:
var KML = new YMaps.KML(URL+'kml/'+KMLfile); KML.setStyle({ hasHint : true });