У нас на сайте такая проблема, когда мы подключаем API яндекс карт то на странице начинается бордак.
Дело в том, что мы находимся на юкозе, а там используется JQUERi.
Нельзя ли вам переменовать имена javascript функций и дать им уникальные имена, а то к примеру у вас есть функция с именем $