Маршрутов в API пока что нет.
Однако, время = расстояние / скорость.
Расстояние между двумя точками Вы можете узнать с помощью метода distance() класса YMaps.GeoPoint.
Рассмотрим для примера движение пешехода.
Средняя скорость пешехода - 5 км/ч ~ 1.4 м/c.
Расстояние, полученное с помощью метода distance() делим на 1.4. Получаем время в секундах.
С помощью метода humanDuration() приводим время в секундах к удобочитаемому строковому представлению.
Я правильно понял Ваш вопрос?