Кластеризатор умеет работать только с объектами-точками.
Не очень понятно, как кластеризовать полигоны - они могут иметь вырезы, самопересечения, и быть, вообще говоря, очень сложными фигурами.
Сейчас единственное, что вы можете сделать - это сгенерировать массив точек, который будет соответствовать центрам полигонов + сделать у этих точек оверлеи, которые будут соответствовать полигону конкретной точки.