Необходимо чтобы пользователь на сайте вводил отправную точку, и прокладывался маршрут до заранее заданной точки.

да

var from = $('input:text#from').val();

ymaps.route([from, 'Адрес заранее заданной точки'], {
    avoidTrafficJams: trafficJams,
    mapStateAutoApply: true
})