Ну при такой формулировке наверное только myMap.getBounds() чтобы определить видимую область, а потом myMap.geoObjects.each() и для каждого объекта проверять попадает ли он в нужную область.
технические вопросы Вы можете задать на Stack Overflow: https://ru.stackoverflow.com/questions/tagged/yandex-maps-api С ошибками в работе сервиса поможет техническая поддержка: https://tech.yandex.ru/maps/doc/feedback/troubleshooting-docpage/?from=club#feedback
