Аналоги IOverlay из 1.x в 2.x

Пожалуйста, поясните подробнее какой именно div вы хотите добавлять, и что именно в нем показывать. Возможно вам нужен не оверлей, а pane.

http://api.yandex.ru/maps/doc/jsapi/2.x/ref/reference/IPane.xml

На карте я рисую большое количество обьектов.

Например, все автобусные остановки и т.п.

Вот, чем я пользуюсь для реализации функционала в google map api и yandex map api 1.x

https://developers.google.com/maps/documentation/javascript/reference?hl=ru#OverlayView

http://api.yandex.ru/maps/doc/jsapi/1.x/ref/reference/ioverlay.xml

В обоих случаях у меня есть контейнер(div), который перемещается(при смене центра) вместе с картой.

В этом контейнере, при отрисовке карты, я создаю свои обьекты - div'ы, которые позиционированы по соответсвующим координатам.

Такое же поведение хочу реализовать в yandex map api 2.

Отсюда вопрос: Какой аналог IOverlay из 1.х в 2-ой версии api

Кажется вам будет проще использовать уже готовый контейнер. Зачем вам создавать отдельный? Посмотрите http://api.yandex.ru/maps/doc/jsapi/2.x/ref/reference/Map.xml#panes - там есть пример. В вашем случае нужен контейнер оверлеев 'overlays'. Полный перечень контейнеров описан тут http://api.yandex.ru/maps/doc/jsapi/2.x/ref/reference/map.pane.Manager.xml

Для контроля над изменениями положения контейнера слушайте на нем события их интерфейса http://api.yandex.ru/maps/doc/jsapi/2.x/ref/reference/IPane.xml

Спасибо! Это помогло.

Еще один вопрос: А как сделать что бы мои элементы прокидывали сообщения до карты?

Например, если мышка находится поверх моего div'а скролл колесом мыши не приводит к изменению масштаба карты.

Ваши объекты должны сами пробрасывать события на карту. Смотрите http://api.yandex.ru/maps/doc/jsapi/2.x/ref/reference/MapEvent.xml
Либо вы можете поместить ваши объекты в другой pane, под pane событий (например в graphics). Но при этом вам нужно будет создать активные области для ваших объектов в пейне событий. Активные области будут отрабатывать интерактивность ваших объектов и они дают больше возможностей для управления интерактивностью. Про активные области можно почитать тут http://api.yandex.ru/maps/doc/jsapi/2.x/dg/concepts/about-hotspots.xml