1. Графический - нарисовать оба региона с обводкой. Нарисовать оба региона с заливкой. (те 4 геообьекта). Таким образом вы "затрете" границу между ними.
2. Разобрать файл данных регионов. Оставить только линии которые принадлежат какому либо из регионов, но не обоим одновременно. Вытащить из АПИ функцию декодирования координат. Отобразить.