позиция карты после закрытия балуна

Это несложно сделать. Нужно запоминать центр карты до открытия балуна, а после закрытия плавно смещать карту с помощью метода panTo().

// Контент для балуна
var longContent = '',
    center;

YMaps.Events.observe(map, map.Events.Click, function (map, e) {
    map.openBalloon(e.getGeoPoint(), longContent);
});

YMaps.Events.observe(map, map.Events.BalloonOpen, function (map, e) {
    center = map.getCenter();
});

YMaps.Events.observe(map, map.Events.BalloonClose, function (map, e) {
    map.panTo(center);
});