В приведенном вами примером координаты меток определяются случайным образом. Если необходимо сохраняться координаты меток, то их можно записать, например, в массив.
Расскажите подробней о решаемой задаче. Постараюсь помочь.
var points = []; for (var i = 0; i points.push( new YMaps.Placemark( new YMaps.GeoPoint( pointLb.getLng() + span.x * Math.random(), pointLb.getLat() + span.y * Math.random() ) ) ); }