Здравствуйте.
Раздел "Задание опций объектов".
// Стиль иконок кластеров.
objectManager.clusters.options.setClusterOptions('preset', 'islands#greenClusterIcons');Метода setClusterOptions() у objectManager.clusters.options не существует. Есть только метод set(). Исправьте.
P.S. Таких косяков в документации полным-полно. Зачем вводить людей в заблуждение? Час целый потратил, чтобы понять, в чём дело, пока огненным жуком не воспользовался. Не думал, что придётся... И вообще она как попало составлена. Одни мучения в ней разбираться.