Для AJAX-сайтов изменения страницы не разделяются на отдельные хиты. Каждый визит в отчёте Вебвизора будет состоять из одного хита, длина которого равна продолжительности визита. При этом все события и действия посетителей сайта должны записываться без проблем.
Конечно. Можете дать номер счётчика и ссылку на отчёт с Вебвизора с неработающим условием сегментации. Можете написать или тут, или отправить в Службу поддержки http://feedback2.yandex.ru/metrika/
Проблема в том, что страницы сайта догружаются аяксом через POST запрос. Вебвизор не делает POST запросов, тк.. потенциально это может быть отправка форм, связанных с покупкой товаров, регистрацией пользователей, авторизацией и тп.. Если использовать GET запрос, тогда должно работать.