Самое главное, как мне кажется, удобство использования и позволяет ли счётчик ответить на те вопросы, ради которых он ставился. И то и другое - субъективные вещи, которые каждый определяет для себя.
Попробую написать основные моменты "за" Метрику (это не значит, что их нет у других счётчиков, но если вас заинтересовали все перечисленные пункты, то значит Метрика вам подойдет).
1. Большой плюс (но и сложность разработки Метрики), что данные нормально посчитаны и доступны пользователям за текущей день, причем с очень небольшой задержкой (т.е. вы ставите счётчик и через 15 мин уже можете радовать клиента первой статистикой, а не абстрактно рассуждать о ней).
2. Возможность задания целей.
3. Бесплатный мониторинг и sms уведомления о доступности сайта (в комплекте с Директом позволяет останавливать показ объявлений при отказе сайта). Замечательный отчет "Трафик по минутам" где видна ежеминутная нагрузка на сайт.
4. Подсчет трафика с рекламных систем (в начале будущего года в этом направлении, надеюсь, преподнесем вам несколько приятных сюрпризов).
5. Такие отчеты как Демография и Карта переходов.
6. Возможность ставить счётчик на AJAX и Flash сайты.
7. Точность, всем кто обращался в Метрику с просьбой разобраться с расхождениями в статистике с различных счётчиков мы стараемся помочь и судя по тому что я видел, у нас одна из самых точных и честных статистик (это все легко проверяется при сопоставлении access.log-ов присылаемых людьми и наших данных)

Очень удобно просматривать переходы по ссылкам,аудиторию по возросту и т.д. Здорово помогает при продвижении.