Если у вас футер на всех страницах - то все верно.
Второй вопрос неправильный - не имеет смысла, на него нет ответа, т.е. вы считаете только страницы где есть счетчик, а где нет - естественно не считает, что тут погрешность - не совсем понятно. Счетчик подгружается браузером пользователя асинхронно.

На самом деле, ответить на эти вопросы может только сам автор.

1. Используется ли на всех страницах один и тот же footer - может знать только он (это же его блог).

2. Насколько часто пользователи блога заходят на ту или иную страницу его блога - тоже только он.

Ну и наконец, может ли он пренебречь тем процентом использования страниц, на которые он не поставит счетчик?  - это тоже вопрос исключительно к самому себе.

чтобы получить корректный ответ надо как минимум указать на каком движке блог и какой счётик вы поставили.

Никакого уменьшения скорости движка не произойдет. если вы используете какую-то CMS (wordpress, joomla, drupal или какая еще), то она работает на сервере, а счетчик работает на стороне клиента, то есть в браузере пользователя, а значит ваш движок в этом никак не участвует.