Проверьте роботность (для людей, у которых роботность - роботы). Если это роботы и у вас есть основания полагать, что подобная ситуация может повториться, вы можете включить фильтрацию роботов по строгим правилам и поведению.

Более подробная информация об учете посещений сайта роботами представлена в разделе помощи: https://yandex.ru/support/metrika/reports/robots.xml
При создании алгоритмов мы свели к минимуму возможность повлиять на ранжирование или индексирование сайтов извне, пожалуйста, не беспокойтесь. Если вы обнаружили, что позиции вашего сайта по определённым запросам резко снизились без видимых причин или какие-либо страницы отсутствуют в поиске, пришлите нам, соответственно, примеры таких запросов или страниц через форму обратной связи https://webmaster.yandex.ru/site/feedback.xml . Мы проанализируем ситуацию и постараемся помочь вам.