Как это? Приток идет по руслу основной реки??? Где это чудо?

Я так понимаю, что говорится о той части линии притока, которая фактически проходит уже по руслу реки, куда приток впадает (строго говоря - от места впадения до середины основной реки, где проходит линия последней).

Это расстояние достаточно редко бывает настолько большим, чтобы появлялось название именно на этом участке. Наоборот, есть смысл делать крайний (считая от устья) участок притока максимально длинным, тогда название будет отображаться корректно, и подсвечиваться приток будет при наведении полностью. 

Надо объединить два участка Бездны (как звучит-то!) и завернуть после острова сразу к Волге, чтобы укоротить. И посмотреть, что получится.

Линию притока, как уже сказал уважаемый , надо довести до линии реки. Я бы только добавил: кратчайшим путём, чтобы линия притока пересекалась с рекой под большим углом, а не шла параллельно руслу. Тогда даже при возникновении описанной ситуации путаницы не будет.

И что вы хотели этим сказать?

Крутой ручей впадает в Томь. Всё понятно)

Потренировался немного и добился, чтобы надпись переместилась (на всех масштабах) :-P

Очевидно, проще! Весь вопрос в корректности таких «буферных» участков. Визуально разницы – никакой. Может быть заметен небольшой разрыв при наведении мышки на мелких масштабах, если контурный объект пропадёт раньше линейного (но обычно бывает наоборот). Что скажет администрация?

upd: Поправка. На мелких масштабах мышка не наводится. Проблема отпадает.