Вот для того и нужно добавлять ссылки, что без них информация получается вырванной из контекста.

Больница имени Пирогова. Территоря больницы поименована полностью, я писал именно об этом. Вы же говорите об одном из пары десятков строений на территории. В таких случаях, нормально и правильно указывать в названии краткий идентификатор организации в целом и идентификатор конкретного объекта (в данном случае - аптека). Тот же самый подход - для именования корпусов вузов, подобных примеров много.

Гм, то есть площадь ленинский д.8 и д.10 имеет общее название Городская клиническая больница №1 им. Н.И. Пирогова? просто я этого нигде не вижу, и если это так то что делать с корпусами которые больнице не принадлежат но распологаются по этим же адресам?

Если в этом есть необходимость, привязку к большице можно написать в описание (или метки).