Добрый день.
1. Да, пешехода в данном случае нужно убирать, при этом следить внимательно, чтобы не образовывалось разрывов в пешеходном графе (той части сети дорог, по которым может ходить пешеход).

2. Да, если согласно ПДД (тут нормы могут отличаться в разных странах) при наличии велодорожки нужно ехать именно по ней, и езда по проезжей части будет нарушением.

3. Нет, везде убирать велосипедиста не нужно, во многих случаях он имеет право ехать по пешеходной дорожке (при отсутствии рядом велодорожки и проезжей части).

По атрибутам есть ещё вопрос, а именно про скоростные ограничения. Согласно 3.2.8 скоростное ограничение для полевых дорог и пешеходных дорожек не задается. В моей местности много отрисованых тротуаров (класс 10) с ограничением 20. Может быть как-то в автоматическом режиме можно подогнать их под правила, то есть убрать ограничения?

1. У нас есть участки улиц с тротуаром с одной стороны и широкой обочиной с другой стороны. На данном участке модератор посоветовал тротуар обозначить, но атрибут доступности пешеходам на основной дороге оставить.
3. Не знаю, как в России, но в Беларуси велосипедист (при отсутствии выделенной велосипедной дорожки) обязан двигаться по тротуару или обочине, при этом не создавая помех движению пешеходов. И только при отсутствии тротуаров или обочины может двигаться по краю проезжей части, не дальше 1 м от края. Гаишники капитально пополняют бюджет на таких штрафах :-(