Ответ на Ваш вопрос вполне четко сформулирован в пункте 2.2.6 Правил: флажок в поле переключателя Является муниципалитетом устанавливается, если административная единица вида «муниципалитет» является адресообразующей — то есть такой, в пределах которой официально не существует самостоятельных населённых пунктов. При этом такие муниципалитеты являются родительскими объектами для всех адресных элементов на своей территории: для улиц, кварталов, хуторов, населённых зон, отдельных адресов.
Официально не являясь населёнными пунктами, такие муниципалитеты должны быть отнесены к типу «Населённый пункт» .
Например, это коммуны во Франции, махалле в Турции и т. п.
В других случаях флажок в поле переключателя не устанавливается.

https://yandex.ru/blog/narod-karta/57d16c642977fb001694229c/57d2df124c69ea00179a9641
По-моему это наиболее полный ответ из тех, что давались про муниципалитеты от администрации.

Всем добра.

По формулировке из правил галочка "является муниципалитетом" подходит только для поселений в Новой Москве. Тем не менее, как было сказано выше в комментариях, проставлять эти галочки сейчас в Москве не стоит. Когда будем на 100% готовы их отображать, мы сделаем это сами.