Разделение ниток, потому что иногда бывает бардак из разных типов маршрутов, если открыть остановку в картах, доступность для инвалидов это понятно, цена это хорошо для городских маршрутов, экспрессы также хорошо выделить, применение названия я уже объяснил в комментарии ниже

не смогу предположить ответа от автора, потому параллельно с ним отвечу вместе с ним.


Часто маршрутная сеть муниципального общественного транспорта выстраивается самостоятельно, дабы полностью удовлетворять потребностям пассажиров в городской черте. Например, в Перми между всеми муниципальными автобусными и трамвайными маршрутами с 15 июля будет действовать система бесплатной пересадки, а также оплата по банковским картам. С 1 февраля текущего года на этих же муниципальных маршрутах возможна оплата Единой транспортной картой, по которой помимо бесплатной пересадки в течение 40/60 минут предоставляется скидка 2 ₽. Это лишь самые откровенно бросающиеся в глаза различия между муниципальными и межмуниципальными маршрутами (именно только между этими двумя типами), смысл разделения которых я вижу.


Пригородные маршруты = межмуниципальные маршруты.


Деление на экспресс/обычный автобус, на мой взгляд, нежелательно, т.к. в понимании каждого пассажира, а также в зависимости от местных реалий сильно отличается. Для некоторых экспресс – это автобус, имеющий лишь первую и вторую конечную; для вторых – проезжающий мимо ряда остановочных пунктов; для третьих проезжающий мимо хотя бы одной остановки (или значимой остановки, в таком случае поднимается вопрос что подразумевать под значимой остановкой, что в большинстве случаев, полагаю, является сугубо субъективно).
Добавить стоимость проезда – в ряде случаев установлена разная стоимость при разных способах оплаты, а также в некоторых регионах встречаются маршруты с разной стоимостью в разное время. Часто на длинных межмуниципальных маршрутах введены тарификационные зоны, при которых стоимость проезда разная в зависимости от длины поездки. Иногда на маршруте работают несколько перевозчиков, каждый из которых устанавливает разную стоимость проезда (это встречается как на маршрутах с тарификационными зонами, так и на маршрутах с фиксированной одной зоной).


По доступности инвалидами несколько лет назад коллеги из Яндекс.Транспорта в ходе встречи с картографами рассказывали, что в Москве на некоторых маршрутах реализовано отдельное отображение меток транспортных средств, которые являются низкопольными. Тогда было заявлено, что этот функционал возможно распространить и на другие территории, однако это до сих пор не произошло, хоть и реализовано на портале МКУ «ГорТранс» (г. Пермь), о чём я информировал тогда сразу же. К слову, аналогично не распространяется на другие даже крупные регионы функционал внесения расписания городских и пригородных электричек для отображения в Яндекс.Картах, а также построения по ним маршруту, но это уже другая пьеса, пускай и также, кажется, беспросветная. 

Допустим, автобус едет из А в Б. Допустим, есть две вариации просто из А в Б и через В, а на картах и то и другое будет написано А-Б. Но если будет название нитки, то можно будет понять различные вариации маршрута

то, что назвал Илья (разные маршруты в одну и ту же точку) — это полезно либо для маршрутов без номеров (Пункт А — Пункт Б), либо для маршрутов с общим номером, но разными буквами, скажем, 13 и 13Д. В этом случае и правда может быть полезно указывать, через какое место едет этот вариант.


Это было бы интересным заданием для интерна — алгоритм генерации маршрутного уточнения ("через центр", "мимо больницы") по заданной паре маршрутов. Автоматически отмечать экспресс-маршруты вообще элементарно — по пропущенным остановкам или по меньшему числу остановок.

> Основной вопрос от пользователя — а есть ли ему разница, обычный это маршрут или необычный?


Ну как бы есть. По городу ходят как городские, так и пригородные ( и.т.п.) маршруты. 
Я, например, первый раз в городе, купил талон в киоске и хочу приехать из пункта А в пункт Б (внутри города). Однако мне предлагает маршрут по городу на межгородском автобусе (о чем я за ранее и не подозреваю). И в итоге я не в курсе, что мой талон в этот автобус не подойдёт и что цена проезда будет другой, и что расплачиваться надо будет наличными и т.п. И более того, не на все маршруты межгородских автобусов можно сесть в городе и проехать до нужной мне остановки (если этот же город == конечной), т.к. часто водители только ВЫСАЖИВАЮТ пассажиров, но не забирают их.