Добрый день!
Есть вот такой вот маленький видеоролик по тому, как подключить рекламу в Яндекс.Поиске для сайта: https://video.yandex.ru/users/yacinema/view/315/
Для того, чтобы подключить рекламу, нужно в интерфейсе Рекламной сети Яндекса добавить еще одну площадку и при выборе типа рекламы - выбрать рекламу в «Форме поиска».
Обратите внимание, что чтобы подключить рекламу, поиск должен быть создан под тем же аккаунтом, под каким сайт представлен в РСЯ. Ну, или наоборот, добавить в РСЯ тот аккаунт, под каким вы создали поиск.