Добрый день!

Насколько я понимаю, вы имеете ввиду поисковые темы в Яндекс.Поиске для сайта?

Поисковые темы нужны, если вы хотите создать поиск более чем по 200 сайтам. В этом случае вы указываете их в поисковой теме и отправляете ее на модерацию.

Этот функционал обычно не требуется, когда вам нужно создать поиск по  конкретному сайту, так как в этом случае выпросто указываете этот сайт в области поиска.