В частности, чтобы ограничить ширину формы, ее достаточно поместить в контейнер, у которого будет задана ширина. Этот вопрос уже обсуждался тут: http://clubs.ya.ru/sitesearch/replies.xml?item_no=106

Вообще вы можете с помощью CSS влиять на внешний вид поисковой формы. Про это рассказывалось во время выступления на конференции Яндекс.Вебмастерская. Видеозапись выслупления доступна тут: http://events.yandex.ru/events/yamasterskaya/msk-apr-2013/talks/799/ (вторая часть, техничесикая)

А какого сайта?:-|