Добрый день!
А какой объем сайта, сколько там примерно страниц? Обычно для среднего сайта нам требуется несколько часов для индексирования. Для крупного ресурса может потребоваться несколько дней.
Если не сложно, продублируйте ваш вопрос в нашу службу поддержки: https://yandex.ru/support/site/troubleshooting/feedback.xml
Мы обязательно проверим, почему сайт так долго индексируется и нет ли там случайно какой-либо проблемы. Сейчас, к сожалению, я не вижу в вопросе, по какому сайту вы создали поиск, и не могу его проверить.