Мы создаем список строк типа ['x0,y0,z0', 'x1,y1,z1',…] затем выполняем распаковку
points_list = ['x0,y0,z0', 'x1,y1,z1',…]
Стандартный сплит
x = [float(point.split(',')[0]) for point in points_list]
y = [float(point.split(',')[1]) for point in points_list]
z = [float(point.split(',')[2]) for point in points_list]
и применяем
ax = plt.axes(projection='3d')
ax.scatter(x, y, z)