Научный метод, подразумевает [imho], в первую очередь - требование объективности, исключающее субъективное толкование результатов, т.е. должны учитываться ВСЕ возможные параметры, влияющие на результат, независимо от того, атеистическое мировозрение у исследователя или любое другое.
Допустим в результате некоторого сложного процесса, мы получаем некоторое вещество (с некоторой химической формулой). Если в ходе вышеуказанного процесса мы добавляем некоторый "ритуал", который с точки зрения наших сегодняшних знаний, никак не должен влиять на результат процесса - и убеждаемся в том, что результат изменился (а он может изменяться не каждый раз, когда мы применяем "ритуал", повторяемость эксперимента очень редко достигает 100%), необходимо заняться исследованием ритуала и выяснить - какие же параметры в эксперимент привносит его проведение, в результате которых, результат МОЖЕТ измениться (а может и нет). А не отмахиваться "с умным видом" от исследования "ненаучных" данных, не допуская, что "священный ритуал" изменит химическую формулу.