Добрый день!
Конечно, налоговая может счесть налогооблагаемыми все поступления на карту, а не только те, что проводились «по бизнесу». В результате налоговики вправе доначислить налог, выписать штраф за недоимку и пеню за несвоевременную уплату.
ИП придется доказывать, какая часть из поступлений является доходами, а какая нет, причем подтверждать это документально. Если доказать это не удастся, то могут вменить «систематическое уклонение от уплаты налогов», что чревато серьезными санкциями.