Предположу, что операционная система выполняет индексацию файлов на HDD, а HDD при этом не в самом лучшем состоянии. В программе для диагностики накопителей будет видно, имеется ли проблема с HDD. Советую Victoria HDD (hdd.by). Можно посмотреть параметры S.M.A.R.T. и состояние поверхности.
Если я прав в своих предположениях, то необходимо будет заменить накопитель на новый.