Сравнение истории с "науками вообще" не слишком перспективно, поскольку другие науки тоже очень сильно отличаются друг от друга. Та же математика от биологии отличается ничуть не меньше, чем история от географии, например. Особенности исторической науки связаны в первую очередь с ее объектом - это прошлое человечества (тут ключевое - это слово "человечество", потому что прошлое изучается и в рамках других наук - той же палеонтологии или геологии). Соответственно особыми будут и источники - продукты человеческой деятельности (что не исключает привлечения источников из других наук, из той же антропологии или географии). Отличия в объекте и источниках приводят к наличию у истории своих уникальных методов (которые есть у каждой науки) - например, ретроспективный метод, метод периодизации, а также ряд методов, получившихся из соединения с общенаучными: историко-сравнительный, историко-генетический и так далее. Что касается некого особого субъективизма в истории, то он связан не с какими-то изъянами в науке, а как раз с особенностью изучаемого объекта, который является слишком сложным, чтобы предполагать наличие единственно верного объяснения (и это не исключительно особенность истории - у тех же физиков существует масса противоречащих друг другу интерпретаций, когда дело касается таких же сложных явлений).
Так что отличия истории от других наук, безусловно есть, также как и отличия вообще между любыми науками. Во многом история схожа с такой наукой как криминалистика, отличаясь от нее скорее широтой охвата.