Вселенная, это: 1- конгломерация мертвой материи; 2 - единое, разумное и живое в каждой своей точке, или 3- компромисс?

Вопрос изначально поставлен некорректно. Нет "мёртвой" и "живой" материи. Вы, живой человек, состоите из мёртвых атомов. Вам это странным, нелогичным - не кажется? Есть просто материя. Которая самодвижется. И приниматет различные формы в своём самодвижении. Та форма самодвижения материи, которую мы называем "жизнью", нам известна только по Земле, на которой сами и живём. Ничего другого о жизни во Вселенной нам не известно. А место Земли во Вселенной - точка, "меры нуль", как говорят математики. Но то, что нам стало известно о самодвижении материи, за 300 лет современной науки, позволяет описать закономерность её самодвижения эмпирическим законом гиперболы. Которая, в дважды логарифмических координатах, выглядит, как прямая. И, возможно, экстраполируя эту закономерность на будущее, мы увидим, как люди, став бессмертными киборгами, оживят и оразумят Вселенную, расселившись по ней, и научившись ею управлять. Но более вероятно то, что люди самоуничтожатся ещё в этом, 21 веке. Слишком они жадны, глупы и агрессивны, слишком сильно в них животное, обезьянье начало. Есть ещё шанс на то, что возникший сильный ИИ станет рассселяться по Вселенной уже  без нас. Как продолжение эволюции Вселенной в её вечном самодвижении. Не знаю, поживём - увидим. Всё свершается на наших глазах, и при нашей жизни. 

Материя - то, что нам дано в ощущениях, а эпитеты "мёртвая", "живая" - относительны, произвольно определяемы, отражают разные фазы развития структур, так что ни 1-е, ни 2-е, ни даже 3-е не соответствует такой миросистеме как Вселенная

Я думаю и первое и второе, да и третьему имеет место быть. Откуда мы знаем, когда наша наука только только преодолела первую ступень развития, что там впереди одному богу известно.

Единое, разумное и живое, но с небольшим уточнением. Когда мы говорим о нашей цивилизации, то называем ее человечеством, но человечество состоит из отдельных людей. Так же и Вселенная состоит из отдельных миров. Можно ли сказать, что они едины?  Вряд ли даже знают друг о друге… Сидят как человечество, каждый в своей скорлупе.

Вселенная - это компромисс  между Богом и Дьяволом. В целом. А в частности - компромисс между верующими и неверующими. Независимо от названия религии.