Не от одной личности зависит, кому будут поклоняться в государстве.
Религии постепенно проникают в общество, её принятие народом - процесс долгий и не делается одномоментно. А если правитель примет не самую популярную в стране веру, едва ли он продержится на троне сколько-нибудь приличный срок.
К тому же, не стоит забывать, что в тюркских традициях заложена веротерпимость. И если хан принимает Ислам, значит эта религия уже достаточно укрепилась среди общества и, что немаловажно, знати.
Но если бы вдруг христианство оказывало больше влияние на турков-сельджуков, то да. Как вы можете заметить, народы, принимающие религию, всё-таки стараются строить для себя храмы.
Гагаузы на Балканском п-ве и караманлиды в центральной Анатолии - это живые примеры православных турок, и они никогда не вели себя так, как вели себя турки-мусульмане, просто в силу того, что христианство вообще и православие в частности - в своей концептуальной основе сильно отличается от ислама.
То есть вы согласны с тем что религия меняет поведение людей