Добрый день, в принципе все равно, но есть нюансы, Zoom требует меньше системных ресурсов, использует меньше траффика, но групповые звонки ограничены в бесплатной версии. Скайп жрет больше интернета и системных ресурсов, но нет ограничений на групповые звонки.
Зум надежнее вариант, если конференция на большое количество пользоватлей, то платную версию. Важно обеспечивать стабильное соединение. Поэтому лучше Зум
Если вы собираетесь использовать мессенджер для конференций, то я бы использовала зум, т.к другие могут принять участие в конференции зум без установки и регистрации. Это и удобно и безопасно, т.к после обновления для каждой конференции нужен пароль.