Основа основ исследований романа в стихах Пушкина – комментарии:
В. В. Набоков «Комментарии к “Евгению Онегину“ Александра Пушкина»
В научной литературе есть огромное множество исследований, посвященных "Евгению Онегину". Приведу здесь несколько классических, раскрывающих разные уровни произведения.
Г. О. Винокур «Слово и стих в “Евгении Онегине”»