«Юнона» станет первым аппаратом, который пролетит над северным и южным полюсами крупнейшей планеты Солнечной системы. Кроме того, она впервые сблизится с облаками Юпитера на расстояния порядка 4100 километров. Основные цели миссии: изучение атмосферы, магнитосферы и строение газового гиганта. Среди задач «Юноны» — определение количества воды на Юпитере. По словам ученых, это поможет выяснить, в какой точке Солнечной системы сформировался Юпитер.