Достаточно создать директиву Disallow (в данном случае, для Яндекса: "User-agent: Yandex Disallow: /" )в файле robots.txt в корне вашего сайта. После следующей индексации сайта, ссылки на ваш сайт исчезнут из поисковой выдачи Яндекса.
Сео П., Смотря что автор вопроса имеет ввиду. Судя по вопросу "удалить ссылку на свой сайт в поисковой выдачи" автор хочет, что бы сайт не индексировался, тем самым не находился в поиске Яши. Тогда запретить Яндексу индексацию через robots будет вполне рабочим решением.