Не гипотезы. Этот процесс хорошо изучен. Жгутик совершает вращательные движения, используя энергию гидролиза АТФ. Если очень-очень сильно упростить, то отсоединение одной фосфорной группы от молекулы АТФ приводит к изменению пространственной конфигурации моторного белка, а следовательно, к преобразованию химической энергии связи АТФ в механическую.
Вот здесь есть подробное описание формирования движения белком динеином со всеми научными выкладками.