Смотря что подразумевается- массовое скопление людей при религиозных обрядах - да способствует распространению инфекции. а вот домашние или одиночные молитвы - нет.
Если рассуждать логически, то становится очевидным, что целование мощей, икон и пр.действительно способствует распространению инфекций.
Освящение воды так же не гарантирует, что она будет чистой.
К примеру при чумном бунте Архиепископ Амвросий, понимая, что скопление народа в одном месте способствует распространению заразы, запретил молебны.
https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%A7%D1%83%D0%BC%D0%BD%D0%BE%D0%B9_%D0%B1%D1%83%D0%BD%D1%82