Вы, безусловно, можете работать в нескольких организациях, в том числе, быть генеральным директором нескольких организаций согласно ст. 282 Трудового кодекса РФ.
Единственным условием является то, что только в одной из организаций у Вас должно быть основное место работы и там должна находиться Ваша трудовая книжка, а в другой компании Вы можете работать по совместительству на основе трудового договора. Совместительство - выполнение работником другой регулярной оплачиваемой работы на условиях трудового договора в свободное от основной работы время.
Заключение трудовых договоров о работе по совместительству допускается с неограниченным числом работодателей, если иное не предусмотрено федеральным законом.
Работа по совместительству может выполняться работником как по месту его основной работы, так и у других работодателей. В трудовом договоре обязательно указание на то, что работа является совместительством.
Не допускается работа по совместительству лиц в возрасте до восемнадцати лет, на тяжелых работах, работах с вредными и (или) опасными условиями труда, если основная работа связана с такими же условиями, а также в других случаях, предусмотренных настоящим Кодексом и иными федеральными законами.