Смотря какая операция. Удаление зуба или желудка - большая разница. Если будет наркоз, то хоть бойся, хоть не бойся - в процессе операции уже неважно. Если местная анестезия, могут дать какой-нибудь транквилизатор. Не советую просто "загнать" страх куда подальше - он никуда не денется и может вылезти в неподходящий момент. Куда лучше рационально осмыслить свои переживания.
В общем и целом, у любой операции есть свои положительные моменты и риски. Если первое перевешивает второе, то операция рекомендуется к проведению.
А вообще, если вопрос к вам лично относится, то напишите, что за операция планируется и я смогу рассказать подробнее.