Т.е в той же Опере есть функция плавного скроллинга в настройках, и есть ли такое же в Яндекс.Браузере?
Попробуйте применить свойство transition: 1s; в css файле. Можно попробовать добавить его к body или к html. Если не сработает, то есть решение на JS.