Не стоит сразу кидать вносить корректировки, поскольку в базе ИФНС выши платежи могут зависнуть на невыясненных.
Поэтому следует запросить сверку и свериться с вашими оплатами и начислениями.
После того как установите расхождениями, то либо вы вносите корректировки в свои бухгалтерские данные и уже на основании этого формируете корректировочную декларацию, либо пишите письмо в ИФНС на внесение корректировки в их базы.
Золотое правило: ваша начисления и оплаты = информации в ИФНС
С уважением,
Руководитель
Нужно заполнить корректировочную декларацию. Указать все доходы и не указывать вычет на который пришел отказ.
Поставить в новой декларации номер корректировки №1.