Из современных исторических экспозиций я бы отметил Музей истории ГУЛАГ, Дом русского зарубежья и Царицыно. Как вариант - музей-заповедник Коломенское или Еврейский музей. Интересная и актуальная историческая экспозиция - очень сложный проект, и они в принципе, большая редкость.
музеи московского кремля, коломенское.. царицыно ,исторический,третьяковка,музей А.С, Пушкина,музей Рерихов, Бородинская панорама,музей М. Ю. Лермонтова,музей Васнецова