У иероглифов, обозначающих цифры в японском языке, два прочтения: китайское и японское.
К тому же, в китайском прочтении у цифр 4, 7 и 9 действительно два варианта. При счёте от 1 до 10 допустимы оба, от 10 и далее – рекомендуется использовать ‘よん' (этот вариант предпочтительнее в целом).
Еще у 0 и 7 есть 2 чтения, используемых примерно равносильно. Можно сказать, что "так сложилось". Практически у всех японских иероглифов есть кунные и онные чтения - это и объясняет несколько вариантов одного числа.