Можно ли лишить бывшего мужа доли в квартире, купленной с использованием средств МК, если он лишён отцовства на детей?

Нет нельзя его лишить доли в собственности, можно только выкупить через договор купли - продажи. При лишении родительских прав он теряет право только на наследство от детей.