Смотря как у вас подключен водяной пол. Если вы его подключили напрямую от линии отопления (это кстати незаконно) и не установили даже крана, тогда отключить его не получится. По-хорошему теплый пол должен быть подключен к линии горячей воды через коллекторы либо обособленный кран.