У магии есть проблема в том,что в настоящее время она не может быть подвергнута изучению.Также стоит извечный вопрос с наличием\отсутствием бога.Нет возможности провести эксперимент,зафиксировать прибором,построить теорию и опровергнуть ее.В связи с этим в настоящее время магия стоит вне научного вопроса.
Скорее отрицает и выдвигает научные объяснение,вроде законы физики+химия...Просто говоря,наука всегда будет находить реальные причины и источники "магии"
Почитайте "Диалоги о магии" - там много пересечений научных теорий и магии.
Наука особо ничего не отрицает, а просто констатирует что нет лабораторно подтвержденных свидетельств магии. А если так, то и говорить, с точки зрения науки, не о чем.