По каким причинам школьнику скучно сидеть на уроках?

Причины самые весомые, которые зависят от учителя две:

Причины от родителей - отсутствие отношения к деятельности ребенка в школе. Это работает так: зачем мне что-то делать, если это все равно никому не нужно.

Причины от детей - начиная от отсутствия познавательного интереса (очень жесткая манера воспитания и послушание поставили лучше, чем любознательность) и продолжая физиологией (что скорее к возрасту и возрастным особенностям). У ребенка изначально позиция ведомого. Не смотрите на характер. Можно иметь сильные волевые качества, сильный характер и харизму, но при этом в любом случае ребенок не знает, что будет дальше. Ребенок не рождается читающим - его учат этому близкие. Ребенок не рождается владеющим инструментами. Вся умелость ребенка - это его будущее, в которое его кто-то должен привести.

Самая главная ошибка взрослых это не понимать.

И я снова возвращаюсь к началу своего ответа - ошибки делают взрослые: учитель, родители. Их надо исследовать и менять действия, ведущие к этим ошибкам.

Скучно бывает, когда урок не интересен, нет ритма, нет настроения у учителя. Только учитель может любую тему сделать удивительно интересной своим желанием, настроем, различными формами ведения урока, своей эрудицией и чувством юмора. С таким учителем дети расстраиваются, когда звенит звонок, и восклицают, что урок так быстро закончился.

Учитель не может ориентироваться на самого сильного ученика - остальные не будут успевать.

Учитель не может ориентироваться на самого слабого ученика - остальным будет скучно.

Учитель вынужден ориентироваться на некоторого среднего ученика. Беда в том, что его-то в классе и нет.

Причин много, начиная от снижения иммунитета, общего состояния ребенка до банального скучного урока, когда учитель просто выдает материал, не заботясь о том, чтобы заинтересовать школьников. Также есть для родителей Памятка по взаимодействию с подростками, в которой можно найти приемы, которые помогут понять, почему  так происходит и как это изменить. 

степень скучности урока для ученика коррелирует с неадекватностью состава и изложения материала: дают далеко не всегда нужное конкретному ученику и нередко в убогой мёртвой форме, что отталкивает даже от интересной в действительности темы.